恐怖組織「動物解放同盟（ALA）」襲擊生物科學研究所，保護了一隻懷孕的雌性猩猩，她更於稍後誕下了半人半猩猩的「猩猩人」查理。查理交由人類的雙親撫育，在 15 年後入讀高中，並在學校與人類女生露絲相遇。

另一方面，ALA 卻變得更加激進，甚至企圖展開連串恐襲！